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酵母雙雜(zá)交檢測(Yeast Two-Hybrid Assay)産品專題
時間:2017-04-06     作者:懋康原創     文章來源:懋康生(shēng)物(wù)    

檢測原理:

酵母雙雜(zá)交系統(Yeast two-hybrid assay)是用于體内研究蛋白(bái)相(xiàng)互作用的一(yī)種非常便利的工(gōng)具,常用的如GAL4為(wèi)基礎的系統,使用酵母轉錄因子GAL4來檢測轉錄激活後的蛋白(bái)相(xiàng)互作用。某些轉錄因子(如GAL4)由兩個(gè)可以分開(kāi),功能(néng)上(shàng)相(xiàng)互獨立的結構域組成,N端有一(yī)個(gè)147個(gè)氨基酸組成的DNA結合域(DNA binding domain,BD),C端有一(yī)個(gè)由113個(gè)氨基酸組成的轉錄激活域(transcription activation domain,AD)。BD可以和上(shàng)遊激活序列(UAS)結合,而AD能(néng)激活UAS下(xià)遊基因進行轉錄。單獨的BD或AD不能(néng)激活基因轉錄,兩者隻有通(tōng)過某種方式結合在一(yī)起形成完整的轉錄激活因子的功能(néng)【見(jiàn)圖1】。酵母雙雜(zá)交系統主要利用酵母GAL4的這個(gè)特性通(tōng)過兩個(gè)雜(zá)交蛋白(bái)在酵母細胞中的相(xiàng)互結合及對報(bào)告基因的轉錄激活來研究活細胞内蛋白(bái)質的相(xiàng)互作用,對蛋白(bái)質之間微弱、瞬間的作用都能(néng)通(tōng)過報(bào)告基因敏感的檢測到(dào)。

 

酵母雙雜(zá)交系統應用:

  1. 對新的與已經蛋白(bái)相(xiàng)互作用的鑒定

  2. 對預測蛋白(bái)相(xiàng)互作用的确認

  3. 對蛋白(bái)相(xiàng)互作用區域的鑒定

 

圖1. 雙雜(zá)交檢測原理圖。兩個(gè)蛋白(bái)分别表達,一(yī)個(gè)(誘餌蛋白(bái)bait protein)融合到(dào)Gal4 DNA結合域表達,另一(yī)個(gè)(誘捕蛋白(bái)prey protein)融合到(dào)Gal4轉錄激活結構域(AD)表達。在Y2HGold酵母菌株中,隻有當兩個(gè)蛋白(bái)之間相(xiàng)互作用并結合到(dào)Gal4反應性啓動子上(shàng)才能(néng)活化報(bào)告基因(AUR1-C, ADE2, HIS3,和MEL1)的表達。

 

酵母雙雜(zá)交系統重要元件(jiàn)介紹(以Matchmarker GAL4-based two hybrid assay為(wèi)例)

1、誘餌(the bait)

為(wèi)了建立GAL4 DNA-BD/bait融合蛋白(bái),推薦使用質粒pGBKT7;

要調查三元蛋白(bái)複合物(wù),推薦使用含2個(gè)MCS區域的三雜(zá)交載體,能(néng)表達GAL4 DNA-BD/bait融合蛋白(bái)和第二個(gè)感興趣蛋白(bái),在bait和prey蛋白(bái)之間發揮橋梁作用。


2、檢測蛋白(bái)作用的四個(gè)報(bào)告基因

Matchmarker gold系統是采用4個(gè)報(bào)告基因/3個(gè)不同bait識别序列的雙雜(zá)交系統(見(jiàn)圖2)。其采用新型穩定的酵母雙雜(zá)交抗生(shēng)素-金擔子素Aureobasidin A(AbA)(貨号:MS0002-1ML),可有效殺死非抗性克隆,從(cóng)而大大降低(dī)背景克隆生(shēng)長(cháng)。同時有效縮減假陽性,由于人和prey蛋白(bái)單獨将結合引起假陽性都需要識别3個(gè)不同序列,激活4個(gè)報(bào)告基因的表達。

4個(gè)報(bào)告基因分别是:1個(gè)AbA抗生(shēng)素篩選報(bào)告基因,2個(gè)營養篩選報(bào)告基因,1個(gè)藍白(bái)斑篩選報(bào)告基因。

1)AUR1-C

AUR1基因的主要突變版,能(néng)夠表達肌醇磷脂酰神經酰胺合成酶(Inositol phosphorylceramide (IPC) synthase)。當蛋白(bái)發生(shēng)作用促使GAL4轉錄激活,AUR1-C基因進行表達。釀酒酵母中此基因的表達孵育其對高(gāo)毒抗生(shēng)素金擔子素Aureobasidin A(AbA)的抗性。由于其背景極其低(dī),這一(yī)篩選報(bào)告子優于單一(yī)的營養缺陷報(bào)告子。


2)HIS3

Y2HGold菌株不能(néng)合成組氨酸,從(cóng)而無法在缺少這一(yī)必須氨基酸的培養基上(shàng)生(shēng)長(cháng)。當誘餌和誘捕蛋白(bái)相(xiàng)互作用,Gal4反應性的His3表達促使細胞合成組氨酸并能(néng)在His缺陷培養基上(shàng)生(shēng)長(cháng)。


3)ADE2

Y2HGold菌株無法在不含腺嘌呤的基本培養基上(shàng)生(shēng)長(cháng),但當兩個(gè)蛋白(bái)相(xiàng)互作用,Ade2表達被活化,細胞能(néng)在Ade缺陷的基礎培養基上(shàng)生(shēng)長(cháng)。


4)MEL1

MEL1編碼α-半乳糖苷酶,存在許多(duō)酵母菌内的天然表達蛋白(bái)。當雙雜(zá)交發生(shēng),MEL1表達和分泌,在底物(wù)X-α-Gal(貨号:MF2003-25MG)存在的情況下(xià),酵母菌落變為(wèi)藍色。


3、三個(gè)不同的結合位點(three different binding sites)

Y2HGold菌株三個(gè)啓動子控制4個(gè)報(bào)告基因是不相(xiàng)關的,除UAS區域的短蛋白(bái)結合位點特異性結合Gal4 DNA-BD。因此,誘捕蛋白(bái)(文庫蛋白(bái)或靶蛋白(bái))與UAS内部或邊緣的不相(xiàng)關序列作用(假陽性)就(jiù)會(huì)自(zì)動被篩查出來。

圖2. Matchmarker酵母菌株的報(bào)告基因構造。Y2HGold中,HIS3,ADE2,MEL1,和AUR1-C報(bào)告基因分别由三個(gè)完全異源的Gal4反應啓動元件(jiàn)-G1,G2,M1操控。而啓動子内的蛋白(bái)結合位點是不同的,雖然每一(yī)個(gè)結合位點與Gal4識别的17-mer共有序列相(xiàng)關聯。


酵母雙雜(zá)交系統操作流程(以Matchmarker GAL4-based two hybrid assay為(wèi)例)

完整的Matchmarker篩選過程包含以下(xià)步驟:

第一(yī)步:執行對照(zhào)實驗;

第二步:誘餌載體的構建及自(zì)我激活和毒性檢測;

第三步:篩選Mate&Plate文庫

第四步:确認和闡釋結果

圖3.使用Mate&Plate文庫進行雙雜(zá)交篩選。捕獲蛋白(bái)(bait protein)是酵母菌Y2HGold表達的Gal4 DNA-BD融合蛋白(bái)。高(gāo)複雜(zá)性文庫表達Gal4 AD融合蛋白(bái),由Y187酵母菌提供。當兩種轉化菌株混合過夜能(néng)接合産生(shēng)二倍體(Diploids)。此二倍體含有4個(gè)報(bào)告基因:HIS3,ADE2,MEL1和AUR1-C,受雙雜(zá)交作用而活化表達。

 

酵母雙雜(zá)交檢測需要産品信息:

我司(懋康生(shēng)物(wù))提供酵母雙雜(zá)交研究需要的一(yī)系列産品,從(cóng)酵母菌株、酵母質粒、酵母培養基到(dào)篩選标志(zhì)(抗生(shēng)素),歡迎來電(diàn)咨詢。

一(yī)、富集培養基(Rich Medium酵母培養)

貨号                           

名稱                                                               

規格                   

價格(元)     

MS6301-350G

YPD Agar Medium YPD瓊脂培養基

350g

550

MS6302-250G

YPD Medium YPD液體培養基

250g

438

MS6303-350G

YPDA Agar Medium YPDA瓊脂培養基

350g

550

MS6304-250G

YPDA Medium YPDA液體培養基

250g

438

【補充描述】:

1)YPD是用于大多(duō)數酵母菌生(shēng)長(cháng)所需的酵母提取物(wù)、蛋白(bái)胨和葡萄糖優化配比後組成的混合物(wù);

2)YPDA培養基是在YPD基礎上(shàng)添加硫酸腺嘌呤,終濃度120 µg/ml。


二、基本培養基(Minimal Medium酵母培養)

貨号               

名稱                                 

規格     

價格(元)

MS6311-467G

Minimal SD Agar Base SD瓊脂基礎培養基

467g

1428

MS6312-267G

Minimal SD Base SD基礎培養基

267g

768

MS6313-270G

Minimal SD Agar Base Gal/Raf SD瓊脂基礎培養基(含半乳糖/棉子糖)

270g

1428

MS6314-185G

Minimal SD Base Gal/Raf SD基礎培養基(含半乳糖/棉子糖)

185g

988

【補充描述】:

1)SD Medium:酵母菌用的基本的合成限定培養基(Minimal synthetically defined medium),包含氮源,碳源(葡萄糖,除非有特殊說明)和DO添加劑(Dropout Supplement)。

2)DO(Dropout Supplement or Solution):特定氨基酸和核苷的混合物(wù),添加到(dào)SD base内以配制SD Medium。DO缺少一(yī)種或者更多(duō)未轉化酵母菌需要的營養成分使其在SD Medium上(shàng)生(shēng)長(cháng),作為(wèi)營養篩選标志(zhì)。 



三、省卻成分氨基酸混合物(wù)(DO Supplements 酵母培養)

類型

名稱

貨号

規格          

價格(元) 

Single Dropout Supplements (SDO)

單一(yī)省卻成分添加劑

DO Supplement -His

MS6316-10G    

10g

418

DO Supplement -Leu

MS6317-10G

10g

418

DO Supplement -Trp

MS6318-10G

10g

418

DO Supplement -Ura

MS6319-10G

10g

418

Double Dropout Supplements (DDO)

雙省卻成分添加劑

DO Supplement -His/-Leu

MS6320-10G

10g

418

DO Supplement -His/-Ura

MS6321-10G

10g

418

DO Supplement -Leu/-Trp

MS6322-10G

10g

418

DO Supplement -Met/-Trp

MS6323-10G

10g

418

DO Supplement -Trp/-Ura

MS6324-10G

10g

418

DO Supplement -Trp/-His

MS6325-10G

10g

418

DO Supplement -Ura/-Leu

MS6326-10G

10g

418

Triple Dropout Supplements (TDO)

三省卻成分添加劑

DO Supplement -His/-Leu/-Trp

MS6331-10G

10g

418

DO Supplement -His/-Leu/-Ura

MS6332-10G

10g

418

DO Supplement -His/-Trp/-Ura

MS6333-10G

10g

418

DO Supplement -Leu/-Met/-Trp

MS6334-10G

10g

418

DO Supplement -Leu/-Trp/-Ura

MS6335-10G

10g

418

DO Supplement -Trp/-His/-Ade

MS6336-10G

10g

418

Quadruple Dropout Supplements (QDO)  

四省卻成分添加劑 

DO Supplement -Ade/-His/-Leu/-Trp   

MS6341-10G

10g              

418

DO Supplement -His/-Leu/-Met/-Trp

MS6342-10G

10g

418

DO Supplement -His/-Leu/-Trp/-Ura

MS6343-10G

10g

418


四、酵母營養缺陷完全培養基(SD+DO Supplments)

類型

名稱

貨号

規格              

價格(元)    

SD + DO Broth 

酵母缺陷型完全培養基(肉湯)          

SD/-His Broth

MS6361-5L          

5L

838

SD/-Leu Broth

MS6363-5L

5L

838

SD/-Trp Broth

MS6365-5L

5L

838

SD/-Ura Broth

MS6367-5L

5L

838

SD/-His/-Leu Broth

MS6381-5L

5L

838

SD/-His/-Ura Broth

MS6383-5L

5L

838

SD/-Leu/-Trp Broth

MS6385-5L

5L

838

SD/-Met/-Trp Broth

MS6387-5L

5L

838

SD/-Trp/-Ura Broth

MS6389-5L

5L

838

SD/-Trp/-His Broth

MS6391-5L

5L

838

SD/-Trp/-Ade Broth

MS6393-5L

5L

838

SD/-Ura/-Leu Broth

MS6395-5L

5L

838

SD/-His/-Leu/-Trp Broth

MS6411-5L

5L

838

SD/-His/-Leu/-Ura Broth

MS6413-5L

5L

838

SD/-His/-Trp/-Ura Broth

MS6415-5L

5L

838

SD/-Leu/-Met/-Trp Broth

MS6417-5L

5L

838

SD/-Leu/-Trp/-Ura Broth

MS6419-5L

5L

838

SD/-Trp/-His/-Ade Broth

MS6421-5L

5L

838

SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp Broth        

MS6431-5L

5L

838

SD/-His/-Leu/-Met/-Trp Broth

MS6433-5L

5L

838

SD/-His/-Leu/-Trp/-Ura Broth

MS6435-5L

5L

838

SD + DO with Agar 

酵母缺陷型完全培養基(瓊脂)

SD/-His with Agar

MS6362-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Leu with Agar

MS6364-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Trp with Agar

MS6366-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Ura with Agar

MS6368-5L

10×0.5 L

1078

SD/-His/-Leu with Agar

MS6382-5L

10×0.5 L

1078

SD/-His/-Ura with Agar

MS6384-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Leu/-Trp with Agar

MS6386-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Met/-Trp with Agar

MS6388-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Trp/-Ura with Agar

MS6390-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Trp/-His with Agar

MS6392-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Trp/-Ade with Agar

MS6394-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Ura/-Leu with Agar

MS6396-5L

10×0.5 L

1078

SD/-His/-Leu/-Trpwith Agar

MS6412-5L

10×0.5 L

1078

SD/-His/-Leu/-Urawith Agar

MS6414-5L

10×0.5 L

1078

SD/-His/-Trp/-Urawith Agar

MS6416-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Leu/-Met/-Trpwith Agar

MS6418-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Leu/-Trp/-Urawith Agar

MS6420-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Trp/-His/-Adewith Agar

MS6422-5L

10×0.5 L

1078

SD/-Ade/-His/-Leu/-Trpwith Agar

MS6432-5L

10×0.5 L

1078

SD/-His/-Leu/-Met/-Trpwith Agar

MS6434-5L

10×0.5 L

1078

SD/-His/-Leu/-Trp/-Urawith Agar

MS6436-5L

10×0.5 L

1078



、篩選抗生(shēng)素(底物(wù))

貨号

名稱

規格            

價格(元) 

MS0002-1ML

Aureobasidin A(AbA)金擔子素A(1 mg/ml)

1ml

900

MF2003-25MG

X-α-Gal 5-溴-4-氯-3-吲哚-α-D-吡喃半乳糖苷

25mg

285

MF2001-1G

X-Gal 5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-吡喃半乳糖苷

1g

280

MF2522-500MG   

5-Fluoroorotic acid monohydrate (5-FOA) 5-氟乳清酸一(yī)水(shuǐ)合物(wù)       

500mg

316

【補充描述】:

1)Aureobasidin A(AbA)金擔子素A是報(bào)告基因AUR1-C的篩選抗生(shēng)素,以判斷酵母菌是否能(néng)表達賦予其AbA抗性的酶。

2)X-α-Gal是α-半乳糖苷酶(由MEL1基因編碼)的底物(wù),當雙雜(zá)交發生(shēng)時MEL1報(bào)告基因正常表達催化底物(wù)發生(shēng)顔色反應,使得酵母菌落呈藍色。

3)X-Gal是ß-半乳糖苷酶(由lacz基因編碼)的底物(wù)。

4)5-FOA(5-氟乳清酸)酵母反篩選(counter-selection)底物(wù),常用于釀酒酵母(URA3)的鑒定和篩選。


、酵母質粒提取試劑盒

貨号             

名稱                                                                                    

規格          

價格(元)  

D3376-01

酵母質粒抽提試劑盒Yeast Plasmid Kit(Omega Biotek)

50次

495

【試劑盒工(gōng)作原理】:

該試劑盒把矽膠柱純化技(jì)術(shù)同經典的SDS堿裂解法結合起來,用戶可在1小(xiǎo)時内從(cóng)酵母培養液中純化出高(gāo)純度的質粒DNA。純化過程不需用任何到(dào)有害的有機(jī)物(wù)抽提,亦不需用到(dào)耗時的乙醇沉澱。質粒DNA的産量依賴于酵母攜帶質粒的拷貝數,酵母菌株以及生(shēng)長(cháng)條件(jiàn)。一(yī)般來說,酵母質粒的拷貝數較低(dī),5.0ml過夜培養液中質粒DNA産量約為(wèi)1.0 µg左右。純化的質粒可直接用于酶切,PCR,電(diàn)轉化等應用。酵母收集後,加入破壁酶和玻璃珠去除細胞壁,用傳統堿裂法裂解細胞,然後将獲得的上(shàng)清液轉移至結合柱結合DNA,經過兩次快速洗滌,最後用無菌水(shuǐ)洗脫出質粒DNA。 


、酵母轉化試劑盒

貨号

名稱

規格             

價格(元)  

MF2501-200T    

Yeast Transformation Kit 酵母轉化試劑盒

200T

768

T2001

Frozen-EZ Yeast Transformation II Kit 酵母轉化試劑盒    

120 Rxns

1246

【補充描述】:

酵母質粒轉化試劑盒,含PEG/liAC酵母轉化需要的所有試劑,操作簡單,轉化效率高(gāo)。 


、酵母雙雜(zá)交菌和感受态細胞

貨号                 

名稱                                                                                

規格          

價格(元)

MF2351-300UL

Y2HGold Yeast Strain 酵母雙雜(zá)交用甘油菌

300μl

咨詢

MF2352-100UL

Y2HGold Chemically Competent Cell 酵母菌化學感受态細胞

100μl

咨詢

MF2353-300UL

Y187 Yeast Strain 酵母雙雜(zá)交用甘油菌

300μl

咨詢

MF2354-100UL

Y187 Chemically Competent Cell 酵母菌化學感受态細胞

100μl

咨詢


、酵母菌載體

貨号               

名稱                                                                            

規格            

價格(元)    

MF3601-20UL

pGBKT7 DNA-BD Vector 酵母雙雜(zá)交克隆載體

20μl

咨詢

MF3602-20UL

pGBKT7-53 Vector 酵母雙雜(zá)交對照(zhào)載體

20μl

咨詢

MF3603-20UL

pGBKT7-Lam Vector  酵母雙雜(zá)交對照(zhào)載體

20μl

咨詢

MF3604-20UL

pGADT7-AD Vector 酵母雙雜(zá)交克隆載體

20μl

咨詢

MF3605-20UL

pGADT7-T Vector酵 母雙雜(zá)交對照(zhào)載體

20μl

咨詢

MF3606-20UL

pBridge Vector 酵母三雜(zá)交克隆載體

20μl

咨詢

MF3609-20UL

pGBT9 Vector 酵母雙雜(zá)交克隆載體

20μl

咨詢

 

 

 — —Written/Edited by V. Shallan【版權歸MKBio懋康所有】

 

 

上海夢澤生物科技有限公司是一(yī)家涉足于生(shēng)命科學和生(shēng)物(wù)技(jì)術(shù)領域研究的試劑、儀器(qì)和實驗室消耗品與實驗服務工(gōng)作,主要從(cóng)事(shì)細胞生(shēng)物(wù)學、植物(wù)學、分子生(shēng)物(wù)學、免疫學、生(shēng)物(wù)化學、蛋白(bái)組學。生(shēng)物(wù)制藥與診斷試劑研發生(shēng)産等領域。 本公司秉承“以人為(wèi)本,以誠為(wèi)信、合同守信”的經營理念。堅持"品質保障"的原則為(wèi)廣大客戶提供優質産品。

 

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