microRNA(miRNA)是一(yī)類小(xiǎo)片段單鏈RNA , 最初是在核内由RNA聚合酶轉錄形成具有帽子結構(7MGpppG)和多(duō)聚腺苷酸尾巴(AAAA)的pri-miRNA,pri-miRNA在核酸酶Drosha及其輔助因子Pasha的作用下(xià)被處理成約70個(gè)核苷的pre-miRNA。pre-miRNA被運輸出核後再由另外一(yī)個(gè)核酸酶Dicer将其剪切形成約22個(gè)核苷酸的成熟miRNA。成熟的miRNA 與RISC組裝成RNA誘導的沉默複合體,通(tōng)過堿基互補配對的方式識别靶mRNA,并根據互補程度的不同指導沉默複合體降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻譯。
圖示1:miRNA的成熟過程
★ 服務内容
2:miRNA的抑制
1:miRNA 的過表達慢(màn)病毒包裝
我公司采用擴增pri-miRNA及其兩端的天然側翼序列來構建miRNA的過表達質粒,并包裝慢(màn)病毒。以實現miRNA在體外(内)的高(gāo)表達。該方法相(xiàng)比化學合成的miRNA,具有可持續性表達,并且能(néng)用于難轉染(例如幹細胞,懸浮細胞等)細胞等優點。比pre-miRNA和mature miRNA 形式的過表達,具有表達效果更好,更能(néng)模拟體内天然的成熟過程。
我公司采用TuD RNA(Tough Decoy RNA)的設計方法構建miRNA的抑制慢(màn)病毒載體。TuD RNA不同于以往的單鏈RNA,它是含有頸環結構的雙鏈RNA , 能(néng)夠抵抗胞内核酸酶的降解,讓miRNA抑制可持續一(yī)個(gè)月(yuè)以上(shàng)。并且,TuD RNA的兩條鏈都包含一(yī)個(gè)miRNA結合位點,能(néng)夠更高(gāo)效地隔離濃度較低(dī)的目标miRNA。因此,相(xiàng)比其它方法,TuD RNA能(néng)夠更長(cháng)效的抑制miRNA。
圖示2:TuD RNA的工(gōng)作原理
3:miRNA的靶基因驗證
由于miRNA是通(tōng)過其seed sequence(5’端2-8位核苷酸)與靶基因的3’UTR結合抑制靶基因的表達。因此,我們将待定目的基因的3’UTR區域構建至報(bào)告基因luciferase的後面,通(tōng)過比較實驗組和對照(zhào)組報(bào)告基因表達的改變(監測熒光(guāng)素酶的活性變化)來間接反映miRNA對目的基因的抑制作用。同時結合定點突變等方法進一(yī)步确認miRNA與靶基因3’UTR的作用位點。
★ 服務說明
1:客戶隻需提供miRBase數據庫中的miRNA編号,我們就(jiù)可以按照(zhào)您的要求完成相(xiàng)關實驗。
2:miRNA的過表達效果受諸多(duō)因素影響,與對照(zhào)組相(xiàng)比,可以提高(gāo)2—1000倍(如果本底表達水(shuǐ)平較低(dī),可以達到(dào)較好的過表達效果,如果本底表達水(shuǐ)平較高(gāo),過表達效果會(huì)相(xiàng)對較低(dī))。
3:我們提供多(duō)個(gè)microRNA慢(màn)病毒載體供客戶選擇(見(jiàn)下(xià)方載體信息);
★ 客戶所得
1:符合客戶要求的産品(質粒+甘油菌 或者 病毒+polybrene);
2:完整的電(diàn)子版實驗報(bào)告(包括實驗材料,步驟,載體圖譜等);
3:完整的測序報(bào)告;
載體編号 |
攜帶标記 |
載體骨架主要元件(jiàn) |
|
熒光(guāng) |
真核抗性 |
||
MicroRNA過表達慢(màn)病毒載體 |
|||
pHY-LV-miR1.1 |
無 |
無 |
CMV-GFP-MCS |
pHY-LV-miR1.2 |
GFP |
無 |
CMV-GFP-MCS-PGK- Puromycin |
MicroRNA抑制慢(màn)病毒載體 |
|||
pHY-LV-KD1.1 |
GFP |
無 |
U6-TuD RNA-CMV-GFP |
pHY-LV-KD1.2 |
RFP |
無 |
U6- TuD RNA -CMV-RFP |
pHY-LV-KD1.4 |
無 |
puromycin |
U6- TuD RNA -CMV-Puromycin |
pHY-LV-KD2.1 |
GFP |
無 |
U6- TuD RNA -EF1α-GFP |
pHY-LV-KD3.1 |
GFP |
無 |
U6- TuD RNA -UBC-GFP |
pHY-LV-KD5.1 |
GFP |
puromycin |
U6- TuD RNA -CMV-GFP-PGK- Puromycin |
pHY-LV-KD5.2 |
RFP |
puromycin |
U6- TuD RNA -CMV-RFP-PGK- Puromycin |
pHY-LV-KD5.4 |
GFP |
puromycin |
U6- TuD RNA -UBC-GFP-PGK- Puromycin |
3’UTR報(bào)告基因慢(màn)病毒載體 |
|||
pHY-LV-Report3.1 |
luciferase |
無 |
CMV-luciferase-MCS |