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組織/細胞裂解液重要特點以及選擇指南(nán)(MKBIO)
時間:2018-10-04     作者:懋康原創     文章來源:懋康生(shēng)物(wù)    


 

前言:

在免疫印迹(WB)、免疫沉澱(IP)、免疫共沉澱(Co-IP),以及染色質免疫沉澱(ChIP)等許多(duō)研究組織或細胞内蛋白(bái)表達,蛋白(bái)純化以及蛋白(bái)-蛋白(bái)、蛋白(bái)-核酸間互作的各種免疫實驗内,首先要做的第一(yī)步就(jiù)是進行組織(細胞)裂解,通(tōng)過破壞細胞膜或細胞核膜的屏障,将要待研究的對象釋放(fàng)到(dào)體外環境中。為(wèi)此,擁有合适的組織/細胞裂解液是開(kāi)展實驗重要的一(yī)環。

 

針對各種下(xià)遊實驗的特點,懋康生(shēng)物(wù)(MKBio)提供幾種常見(jiàn)的組織/細胞裂解液,基本涵蓋用戶需求。

 

總表:各種組織/細胞裂解液主要特點和應用差異(MKBIO)

産品

貨号

MP1501

MP1502

MP1503

MP1504

MP1505

MP1506

MP1507

MP1508

産品

名稱

RIPA裂解液(強)

RIPA裂解液(中)

RIPA裂解液(弱)

WB/IP裂解液

NP-40裂解液

SDS裂解液

RIPA裂解液(強,無抑制劑)

WB/IP裂解液(無抑制劑)

有效裂解成分

1% Triton X-100,1%脫氧膽酸鈉,0.1% SDS

1% NP-40,0.5%脫氧膽酸鈉,0.1% SDS

1% NP-40,0.25%脫氧膽酸鈉

1% Triton X-100

1% NP-40

1% SDS

1% Triton X-100,1%脫氧膽酸鈉,0.1% SDS

1% Triton X-100

裂解強度

溫和

溫和

溫和

溫和

對膜蛋白(bái)的提取

很好

較好

一(yī)般

一(yī)般

一(yī)般

很好

很好

一(yī)般

對胞漿蛋白(bái)的提取

很好

很好

很好

很好

很好

很好

很好

很好

對核蛋白(bái)的提取

很好

較好

較好

較好

較好

很好

很好

較好

胞漿磷酸化蛋白(bái)提取

很好

很好

很好

很好

很好

很好

很好

很好

核轉錄因子提取

很好

很好

很好

很好

很好

很好

很好

很好

蛋白(bái)酶抑制劑

含有

含有

含有

含有

含有

含有

不含

不含

磷酸酶抑制劑

含有

含有

含有

含有

含有

含有

不含

不含

主要用途

WB,IP

WB,IP

WB,IP,Co-IP

WB,IP,Co-IP

WB,IP,Co-IP

WB,ChIP

WB,IP

WB,IP,Co-IP


組織/細胞裂解液選擇說明:

a)   對于普通(tōng)的WB,IP,Co-IP,推薦使用WB/IP裂解液(# MP1504-100ML),經此裂解所得的産物(wù)沒有非常粘滞的透明狀DNA團塊形成,不必采用超聲處理等就(jiù)可以非常理想地用于後續操作。另外,此裂解液裂解的産物(wù)也适合用于磷酸化蛋白(bái)的WB檢測。

b)   對于某些特殊蛋白(bái)的IP,如果WB/IP裂解液(# MP1504-100ML)效果不理想,可嘗試用RIPA(強,中,弱)或NP-40裂解液。若發現IP背景很高(gāo),說明非特異性蛋白(bái)被沉澱下(xià)來,則需選用裂解強度較高(gāo)的裂解液,如RIPA(強或中)。如果發現目的蛋白(bái)無法被沉澱下(xià)來,說明裂解液的強度過強,可使用較溫和的裂解液如RIPA(弱)或NP-40裂解液。

c)   對于某些難溶解蛋白(bái)的WB,如果WB/IP裂解液(# MP1504-100ML)效果不理想,可嘗試使用裂解強度更高(gāo)的裂解液如RIPA(強,中)或SDS裂解液。

d)   對于特定用途需要自(zì)行添加特定抑制劑或不需添加抑制劑,可考慮選擇RIPA裂解液(強,無抑制劑)(# MP1507-100ML)或WB/IP裂解液(無抑制劑)(# MP1508-100ML),後者很多(duō)情況下(xià)兼容酶活性和生(shēng)物(wù)小(xiǎo)分子的檢測,具體兼容性如何請自(zì)行測試,我司無相(xiàng)應數據提供。

 

補充知識點

一(yī)、 關于去垢劑(detergents

1.1   去垢劑的分類

幾種組織/細胞裂解液裂解強度(應用)的差異主要還(hái)是配方中去污劑種類和濃度的不同。去污劑分為(wèi)變性去污劑(denaturing detergents)和非變性去污劑(non-denaturing detergents),前者可以是陰離子比如SDS,或陽離子比如乙基三甲基溴化铵,這些去垢劑總體來說破壞膜和通(tōng)過打破蛋白(bái)-蛋白(bái)間相(xiàng)互作用來變性蛋白(bái);非變性去垢劑分為(wèi)非離子比如Triton X-100,膽鹽比如膽酸鹽類和兩性離子去垢劑比如CHAPS。


1.2   常見(jiàn)去垢劑(用于蛋白(bái)增溶)的特征

去垢劑

類型

聚集數

膠束分子量

臨界膠束濃度(CMC, mM)

臨界膠束濃度(CMC, %,w/v)

濁點(℃)

透析去除

Triton X-100

非離子型

140

90,000

0.24

0.0155

64

Triton X-114

非離子型

/

/

0.21

0.0113

23

NP-40

非離子型

149

90,000

0.29

0.0179

80

Brij-35

非離子型

40

49,000

0.09

0.1103

>100

Brij-58

非離子型

70

82,000

0.077

0.0086

>100

Tween-20

非離子型

/

/

0.06

0.0074

95

Tween-80

非離子型

60

76,000

0.012

0.0016

/

 

Octyl Glucoside

非離子型

27

8,000

23-25

0.6716-0.7300

/

Octylthio Glucoside

非離子型

/

/

9

0.2772

>100

SDS

陰離子

62

18,000

288

6-8

0.1728-2304

CHAPS

兩性離子

10

6,149

8-10

0.4920-0.6150

>100

CHAPSO

兩性離子

11

6,940

8-10

0.5048

90

 

二、 幾個(gè)免疫實驗的基本概念

免疫印迹(Immunoblotting):又(yòu)稱蛋白(bái)質印迹(Western blotting),是根據抗原抗體的特異性結合檢測複雜(zá)樣品中的某種蛋白(bái)的方法。該法是在凝膠電(diàn)泳和固相(xiàng)免疫測定技(jì)術(shù)基礎上(shàng)發展起來的一(yī)種新的免疫生(shēng)化技(jì)術(shù)。由于免疫印迹具有 SDS-PAGE 的高(gāo)分辨力和固相(xiàng)免疫測定的高(gāo)特異性和敏感性,現已成為(wèi)蛋白(bái)分析的一(yī)種常規技(jì)術(shù)。免疫印迹常用于鑒定某種蛋白(bái),并能(néng)對蛋白(bái)進行定性和半定量分析。結合化學發光(guāng)檢測,可以同時比較多(duō)個(gè)樣品同種蛋白(bái)的表達量差異。

 

免疫沉澱(Immunoprecipitation):是利用抗體特異性反應純化富集目的蛋白(bái)的一(yī)種方法。抗體與細胞裂解液或表達上(shàng)清中相(xiàng)應的蛋白(bái)結合後,再與蛋白(bái)A/G或二抗偶聯的agarose或Sepharose珠子孵育,通(tōng)過離心得到(dào)珠子-蛋白(bái)A/G或二抗-抗體-目的蛋白(bái)複合物(wù),沉澱經過洗滌後,重懸于電(diàn)泳上(shàng)樣緩沖液,煮沸5-10min,在高(gāo)溫及還(hái)原劑的作用下(xià),抗原與抗體解離,離心收集上(shàng)清,上(shàng)清中包括抗體、目的蛋白(bái)和少量的雜(zá)蛋白(bái)。 

 

免疫共沉澱(Co-Immunoprecipitation):是以抗體和抗原之間的專一(yī)性作用為(wèi)基礎的用于研究蛋白(bái)質相(xiàng)互作用的經典方法。是确定兩種蛋白(bái)質在完整細胞内生(shēng)理性相(xiàng)互作用的有效方法。當細胞在非變性條件(jiàn)下(xià)被裂解時,完整細胞内存在的許多(duō)蛋白(bái)質-蛋白(bái)質間的相(xiàng)互作用被保留了下(xià)來。當用預先固化在argarose beads上(shàng)的蛋白(bái)質A的抗體免疫沉澱A蛋白(bái),那麽與A蛋白(bái)在體内結合的蛋白(bái)質B也能(néng)一(yī)起沉澱下(xià)來。再通(tōng)過蛋白(bái)變性分離,對B蛋白(bái)進行檢測,進而證明兩者間的相(xiàng)互作用。

 

染色質免疫共沉澱技(jì)術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP):是一(yī)種适用于研究蛋白(bái)質與生(shēng)物(wù)體細胞中 DNA 相(xiàng)互作用的經典方法,這項技(jì)術(shù)幫助研究者判斷在細胞核中基因組的某一(yī)特定位置會(huì)出現何種組蛋白(bái)修飾 。檢測原理是當在活細胞狀态下(xià)固定蛋白(bái)質-DNA 複合物(wù),并将其随機(jī)切斷為(wèi)一(yī)定長(cháng)度範圍内的染色質小(xiǎo)片段,然後通(tōng)過免疫學方法沉澱此複合體,特異性地富集目的蛋白(bái)結合的 DNA 片段,通(tōng)過對目的片斷的純化與檢測,從(cóng)而獲得蛋白(bái)質與 DNA 相(xiàng)互作用的信息。

 

 

 — —Written/Edited by V. Shallan【版權歸MKBio懋康所有】

 

 

上海夢澤生物科技有限公司是一(yī)家涉足于生(shēng)命科學和生(shēng)物(wù)技(jì)術(shù)領域研究的試劑、儀器(qì)和實驗室消耗品與實驗服務工(gōng)作,主要從(cóng)事(shì)細胞生(shēng)物(wù)學、植物(wù)學、分子生(shēng)物(wù)學、免疫學、生(shēng)物(wù)化學、蛋白(bái)組學。生(shēng)物(wù)制藥與診斷試劑研發生(shēng)産等領域。 本公司秉承“以人為(wèi)本,以誠為(wèi)信、合同守信”的經營理念。堅持"品質保障"的原則為(wèi)廣大客戶提供優質産品。


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