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MKRed Nucleic Acid Gel Stain (10,000× in Water) 核酸凝膠染料(效果同GelRed)
時間:2016-04-14     作者:懋康     文章來源:本站    
 

MKRed Nucleic Acid Gel Stain (10,000× in Water) 核酸凝膠染料(效果同GelRed)

MKRed核酸染料特點

●無毒性:MKRed獨特的油性和大分子量特點使其不能(néng)穿透細胞膜進入細胞内,艾姆斯氏試驗結果也表明,該染料的誘變性遠(yuǎn)遠(yuǎn)小(xiǎo)于EB。

●靈敏度高(gāo):适用于各種大小(xiǎo)片段的電(diàn)泳染色,對核酸遷移的影響小(xiǎo)于SYBR Green I。

●穩定性高(gāo):适用于使用微波或其它加熱方法制備瓊脂糖凝膠;室溫下(xià)在酸或堿緩沖液中極其穩定,耐光(guāng)性強。

●信噪比高(gāo):樣品熒光(guāng)信号強,背景信号低(dī)。

●操作簡單:與EB一(yī)樣,在預制膠和電(diàn)泳過程中染料不降解;而電(diàn)泳後染色過程也隻需30分鍾且無需脫色或沖洗,即可直接用紫外凝膠透射儀觀察。

●适用範圍廣:可選擇電(diàn)泳前染色(膠染法)或電(diàn)泳後染色(泡染法);适用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電(diàn)泳;可用于dsDNA、ssDNA或RNA染色。

●與EB有相(xiàng)同的光(guāng)譜特性,無需改變濾光(guāng)片及觀察裝置:标準的EB濾光(guāng)片或SYBR濾光(guāng)片都适用,使用與觀察EB相(xiàng)同的普通(tōng)紫外凝膠透射儀觀察即可,在300nm紫外光(guāng)附近可得到(dào)最佳激發。但是MKRed不能(néng)被488 nm氩離子激光(guāng)器(qì)或相(xiàng)似波長(cháng)的可見(jiàn)光(guāng)完全激發,因此不推薦使用此類激發裝置的成像系統。對于此類裝置,我們推薦您使用MKGreen(Cat# 011或012),它和SYBR Green I的光(guāng)譜相(xiàng)似,靈敏度相(xiàng)當,但更加穩定。


MKRed使用方法簡介

1.膠染法(用法同EB)(推薦方法)

(1)制膠時加入MKRed核酸染料(例如:每50mL瓊脂糖溶液中加入5μL MKRed 10,000×MKRed以此比例類推)。

(2)按照(zhào)常規方法進行電(diàn)泳。

注意事(shì)項:

♦ 此方法染色染料用量相(xiàng)對較少。500 μL染料大約可以做100塊50mL的膠。

♦ 由于MKRed具有良好的熱穩定性,可以在熱的瓊脂糖溶液中直接添加,而不需要等待溶液冷卻。搖晃,振蕩或者翻轉以保證染料充分混勻。也可以選擇将MKRed儲液加到(dào)MKRed和電(diàn)泳緩沖液中,然後用微波爐或其他常用方式加熱以制備瓊脂糖凝膠。MKRed兼容所有常用的電(diàn)泳緩沖溶液。

♦ 如果總是看(kàn)到(dào)條帶彌散或分離不理想,建議使用泡染法染色以确認問題是否與染料有關。如果染色後問題依舊(jiù)存在,則說明問題與染料無關,請嘗試:降低(dī)瓊脂糖濃度;選用更長(cháng)的凝膠;延長(cháng)凝膠時間以保證邊緣清晰;改進上(shàng)樣技(jì)巧或選擇泡染法染色。

♦ 此方法不适合預制聚丙烯酰胺凝膠,對于聚丙烯酰胺凝膠請使用泡染法。

2.泡染法

(1)按照(zhào)常規方法進行電(diàn)泳。

(2)用H2O将MKRed10,000×儲液稀釋約3,300倍到(dào)0.1M NaCl中,制成3×染色液。(例如将15μL MKRed10,000×MKRed 1M NaCl加到(dào)45mL H2O中)。

(3)将凝膠小(xiǎo)心地放(fàng)入合适的容器(qì)中,如聚丙烯容器(qì)中。緩慢(màn)加入足量的3×染色液浸沒凝膠。室溫振蕩染色30min左右,最佳染色時間根據凝膠厚度以及瓊脂糖濃度不同而略有不同。對于含3.5~10%丙烯酰胺的凝膠,染色時間通(tōng)常介于30min到(dào)1h,并随丙烯酰胺含量增加而延長(cháng)。

注意事(shì)項:

♦ 用泡染法染色時,染料用量較多(duō)。單次使用的染色液可重複使用3次左右。

♦ 3× MKRed染色液可以大量制備,在室溫下(xià)避光(guāng)保存直至用完。

幾種核酸染料比較

名稱

靈敏度

穩定性

對DNA 遷移的影響

安全性

适用性

MKRed

高(gāo)

高(gāo)

條帶不彎曲,DNA片段不遷移

·        是一(yī)種獨特的油性大分子,不易揮發升華,不易吸入人體,不能(néng)穿透細胞膜進入活體細胞内,安全無毒。

·        艾姆斯氏測試結果表明,MKRed在凝膠染色濃度下(xià)完全沒有誘變性,因此完全沒有緻癌毒性。

通(tōng)用大小(xiǎo)片段電(diàn)泳染色,與EB有相(xiàng)同的光(guāng)譜特性,無需改變濾光(guāng)片及觀察裝置。标準的EB濾光(guāng)片或SYBR濾光(guāng)片都适用,使用普通(tōng)紫外凝膠透射儀觀察即可,在300nm紫外光(guāng)附近可得到(dào)最佳激發。

MKGreen

高(gāo)

高(gāo)

條帶不彎曲,DNA片段不遷移

① 是一(yī)種獨特的油性大分子,不易揮發升華,不易吸入人體,不能(néng)穿透細胞膜進入活體細胞内,安全無毒。
② 艾姆斯氏測試結果表明,MKGreen在凝膠染色濃度下(xià)完全沒有誘變性,因此完全沒有緻癌毒性。

通(tōng)用大小(xiǎo)片段電(diàn)泳染色,适用于使用254nm激發的紫外凝膠透射儀或可見(jiàn)光(guāng)凝膠透射儀觀察。

SYBR Green I

高(gāo)

低(dī)

染料濃度較高(gāo)時,條帶容易彎曲,DNA片段遷移的現象明顯

屬花箐染料,能(néng)透過細胞膜進入活體細胞内,但容易生(shēng)物(wù)降解,不會(huì)在體内殘留,安全無毒。

100bp以上(shàng)電(diàn)泳染色,适用于使用254nm激發的紫外凝膠透射儀或可見(jiàn)光(guāng)凝膠透射儀觀察。

EB

低(dī)

高(gāo)

條帶不彎曲,DNA片段不遷移

① 分子量小(xiǎo),易揮發升華,易吸入人體,不易生(shēng)物(wù)降解,在體内長(cháng)期殘留。
②  艾姆斯氏測試結果表明,EB容易引起有機(jī)體突變,是一(yī)種強誘變劑,具有高(gāo)緻癌性。

100bp以上(shàng)電(diàn)泳染色,背景熒光(guāng)信号高(gāo);使用普通(tōng)紫外凝膠透射儀觀察。

Goldview

低(dī)

高(gāo)

條帶不彎曲,DNA片段不遷移

① 主要成分為(wèi)吖啶橙,是一(yī)種煤焦油提取物(wù),具有高(gāo)毒,緻癌,高(gāo)誘變性。
② 易揮發升華,易吸入人體,能(néng)穿透細胞膜進入活體細胞内,不易生(shēng)物(wù)降解,在體内長(cháng)期殘留。

100bp以上(shàng)電(diàn)泳染色,背景熒光(guāng)信号高(gāo);适用于使用254nm激發的紫外凝膠透射儀或可見(jiàn)光(guāng)凝膠透射儀觀察。

 

特别提醒:

♦ 如果您使用的是紫外成像儀,請選擇MKRed;如果您使用激光(guāng)成像儀或希望在可見(jiàn)光(guāng)下(xià)觀測,請選擇MKGreen。

♦ 在極少數情況下(xià),質粒經某些酶切後的DNA樣品會(huì)出現拖尾和分辨率降低(dī),此時建議同時嘗試兩種染色方法以決定哪種方法更加合适。

訂購信息:

品名

産地

貨号

規格

單價

備注

MKRed(10,000×水(shuǐ)溶液)

MKbio

MF0754-500UL

500ul

460

現貨

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